第1話 (24分30秒)

鋼の錬金術師

「氷結の錬金術師」アイザックがセントラルに姿を現した。彼を捕縛するため、「鋼の錬金術師」エドとその弟・アルが動き出す。

第1話 (24分30秒)

地下にひそむ者たち

イズミの乱入により転機を迎えるグリードとの戦い。だがそこへ、キング・ブラッドレイ率いる国軍が突入し、殲滅を開始する。

第1話 (24分30秒)

狭間の宴

村の祭りを見つめるホーエンハイムに、ピナコが酒を持ってやってくる。彼女はこの国の在り方やエドたちの旅路について話す。

第1話 (24分30秒)

フラスコの中の小人 (ホムンクルス)

ホークアイと再会し、大総統の息子・セリムの正体を知るロイ。その頃「お父様」は、在りし日のクセルクセス王国の夢を見ていた。

第1話 (24分30秒)

復讐の炎

ラジオ局を占拠したブレダたち反乱軍一派。一方、中央司令部地下で戦うエドやスカーたちの元に、エンヴィーが現れる。

第2話 (24分30秒)

はじまりの日

母を蘇らせるため、人体錬成に挑むエドとアルを待っていたのは大きな代償だった。絶望に沈む兄弟の前にひとりの軍人が現れる。

第2話 (24分30秒)

東方の使者

セントラルへ向かうスカーの前に現れた謎の少女、メイ。錬丹術を使う彼女は東の大国・シンからアメストリスへやって来たと話す。

第2話 (24分30秒)

おとうさま

「お父様」のところへ着いたアルとシャオメイ。その時、突然グラトニーの腹が裂け、なかからエド、リン、エンヴィーが現れる。

第2話 (24分30秒)

奈落

キンブリーとその部下たちを始末しようと動き出すマイルズたち。だが計画に気づいたキンブリーから、反撃に遭ってしまう。

第2話 (24分30秒)

烈火の先に

エンヴィーの罠を絶妙なコンビネーションで乗り切っていくロイたち。長年追い求めてきた仇敵を前に、ロイが取った行動とは……。

第3話 (24分30秒)

邪教の街

「奇跡の業」を使うという教主・コーネロは、等価交換の原則に反した錬金術を行っていた。エドとアルはことの真相を探るが……。

第3話 (24分30秒)

戦友の足跡

バリーとの接触で、ヒューズ殺害の真相を掴み始めたロイ。その動きはやがて、ホムンクルスたちの知るところとなる。

第3話 (24分30秒)

愚者の足掻き

捕まったエドとアルは、お父様の指示でブラッドレイの元へ。そして軍の上層部がすでに敵の手に落ちていたことを知らされる。

第3話 (24分30秒)

反撃の兆し

スカーの兄の書を読み解こうと試みるメイとマルコー。意識の戻ったアルからヒントを得たメイは、一つの錬成陣に辿りつく。

第3話 (24分30秒)

大人たちの生き様

アームストロングたちに瀕死の重傷を負わせるスロウス。それでも逃げないアームストロングの元に、意外な人物が助けに入る。

第4話 (24分30秒)

錬金術師の苦悩

２年前、人語を解する合成獣の錬成に成功した錬金術師・タッカーを紹介されたエドとアル。エドたちはその娘ニーナと親しくなる。

第4話 (24分30秒)

冷徹な焰

ヒューズ殺害の犯人として拘束されたロス。その留置所をバリーが襲撃し、居合わせたリンとともに彼女を連れて逃亡する。

第4話 (24分30秒)

イシュヴァール殲滅戦

イシュヴァール戦についてホークアイに尋ねるエド。時同じくしてマルコーも、スカーにイシュヴァールで軍が起こしたことを話す。

第4話 (24分30秒)

蟻のひと噛み

イシュヴァール人のスラムに身を寄せるマルコーたちの元へ、エンヴィーがやってくる。応戦するマルコーやジェルソたちだが……。

第4話 (24分30秒)

大総統の帰還

「お父様」と対峙するホーエンハイム。彼は自らの中にある53万6329人の魂を使い、「お父様」を内側から破壊しようとする。

第5話 (24分30秒)

哀しみの雨

国家錬金術師ばかりを殺害する「傷の男（スカー）」がイーストシティに現れた。エドとアルは偶然、そのスカーと遭遇する。

第5話 (24分30秒)

小さな人間の傲慢な掌

ロイの命令でリゼンブールへ向かったエド。ところが到着早々、ブレダの手引きで伝説の王都・クセルクセス遺跡へと旅立つことに。

第5話 (24分30秒)

520センズの約束

お父様と戦っていた時も、変わらず力を発揮できた錬丹術に光明を見出すエドとアル。早速、２人はメイの行方を探すのだが……。

第5話 (24分30秒)

バリンバリンの全開

リオールでホーエンハイムと再会したアルたち。その頃、ノースシティでは、エドの口座から金を引き出すダリウスの姿があった。

第5話 (24分30秒)

永遠の暇 (いとま)

「お父様」を見つけ出すため、地下を進むエドたちは、自分を「キング・ブラッドレイを作った男」と紹介した医者と出会う。

第6話 (24分30秒)

希望の道

壊れた機械鎧を直すため、故郷へ向かうエドとアル。途中の駅で見かけた男・マルコーはかつて「賢者の石」について研究していた。

第6話 (24分30秒)

死なざる者の死

バリーを追って、第三研究所の地下へ潜入するロイたち。進んだ先でハボックとロイは、彼らを始末しにきたラストと遭遇する。

第6話 (24分30秒)

大総統の息子

メイたちが北へ向かったことを知るエド。アームストロングは彼に、北へ着いたら真っ先にブリッグズ要塞の将軍に会えと指示する。

第6話 (24分30秒)

約束の日

シンへ帰るためユースウェルに立ち寄るメイ。一方、エドたちはロイの隠れ家で一時的に身体の主導権を取り戻したリンと再会する。

第6話 (24分30秒)

ひとばしら

ついにブラッドレイを城壁から叩き落とすグリードたち。その頃、無数の影の手により真理の目の中に引きずり込まれたエドは……。

第7話 (24分30秒)

隠された真実

マルコーの研究資料を探しに国立中央図書館第一分館へやって来たエドとアル。だが彼らが見たものは、全焼した分館の跡だった。

第7話 (24分30秒)

墓前の父

エドとアルの父ホーエンハイムがリゼンブールへ戻ってきた。だが母トリシャに苦労をかけた彼に、エドは憎悪の感情を隠さない。

第7話 (24分30秒)

ブリッグズの北壁

北へと走る貨物車に潜伏したスカー。そこへキンブリーが現れる。兄を殺した張本人を前にして、スカーの怒りは頂点に達し……。

第7話 (24分30秒)

迫る影

リゼンブールに戻ったウィンリィは、そこでエドと再会。一方、アルは、潜伏先で再び肉体に魂が引っ張られる感覚に襲われる。

第7話 (24分30秒)

失われた光

金歯医者とロイの対決の場所に現れたブラッドレイ。ロイを襲うブラッドレイは、彼を床に縫い止め、強制的に人体錬成を行う。

第8話 (24分30秒)

第五研究所

元第五研究所へ忍び込んだエドは、そこで賢者の石の錬成陣を発見。その時、鎧に身を包んだナンバー４８がエドに襲い掛かかる。

第8話 (24分30秒)

愚者の前進

ラストの一件で入院したロイたちのもとへ見舞いに訪れたエド。そこで彼は、自分たちが相対している存在の巨大さに戦慄する。

第8話 (24分30秒)

氷の女王

ようやくブリッグズ要塞に辿りついたエドとアル。指揮官のオリヴィエに目的を話した２人は、メイ捜索のための協力を願う。

第8話 (24分30秒)

闇の使者

ホーエンハイムと再会したエドたちは、彼から「お父様」が日蝕を利用して、真理の扉を開けようとしていることを聞かされる。

第8話 (24分30秒)

天の瞳、地の扉

「お父様」のもとに出揃った５人の人柱。だが、エドやアルたちはあきらない。同じ頃、ブラッドレイとスカーの戦いも始まった。

第9話 (24分30秒)

創られた想い

「自分は兄さんに魂も記憶も作られた偽者なのではないか？」。バリーが放った一言に、アルは心を乱される……。

第9話 (24分30秒)

遠くの背中

エドとアルがスカーと戦っていることを聞き、現場へ向かうウィンリィ。そこで彼女は、スカーが自分の両親を殺した犯人だと知る。

第9話 (24分30秒)

この国のかたち

襲撃してきたスロウスに反撃を始めるオリヴィエたち。それは全てを凍てつかせるブリッグズの風土を利用した驚くべきものだった。

第9話 (24分30秒)

地下道の誓い

一向に倒れる気配のないプライドに苦戦を強いられるハインケル。一方、セリムの正体を調べ上げたロイに、軍の密偵が忍び寄る。

第9話 (24分30秒)

神を呑みこみし者

アメストリス国民全員の命を使い、天の扉から強大な力を引き出した「お父様」。すべてが絶望的に思われた、その時……。

第10話 (24分30秒)

それぞれの行く先

病室で第五研究所の顛末を話すエドとアル。大総統キング・ブラッドレイはエドたちに、軍内部に不穏な存在があることを告げる。

第10話 (24分30秒)

戦場 (いくさば) の少女

ウィンリィを軍に託し、再びスカーとの戦いに赴くエドたち。その頃、ランファンを抱えたリンはグラトニーに追い詰められていた。

第10話 (24分30秒)

家族の肖像

人気のない山中に佇むホーエンハイム。胸から赤い血の塊を解き放つ彼の脳裏には、在りし日の家族の思い出が甦っていた。

第10話 (24分30秒)

親子の情

グラトニーの能力を手に入れたプライドに、追い詰められるエドたち。アルは、兄の窮地を知り、ホーエンハイムに一計を提案する。

第10話 (24分30秒)

凄絶なる反撃

「お父様」の反撃に遭い、右腕の機械鎧を壊されるエド。魂を取ろうと迫る「お父様」から兄を救うため、アルは非情の決意をする。