ワンダービートスクランブル

西暦2121年、謎の移動小惑星を追っていた宇宙生命探査船がスギタ隊長もろとも消息を絶った。 息子のススムは、父の友人ドクター・ミヤにスカウトされて体内医療救急隊、ホワイト・ペガサスの一員となり、人体内の調査のためにミクロ化されて出動艇に乗り込む。 「ワンダービート号」発進!!

ススムは友人のケンイチの眼球内で未知の生物に襲われエンザーミサイルを発射して無事帰還する。体勢を整えて再び水晶体に潜入するが、謎の宇宙船はメドロモンスターを操ってススムを攻撃する。薄れる意識の中で行方不明の父が持っていたオルゴールの音が聞こえるが宇宙船は消えていた。

ドクター・ミヤは謎の異星人を「ヒュー」と名づけた。スペンサー博士は移動小惑星X23こそ「ヒュー」の星だと推定した。 スペンサー博士の車中で長官の孫娘メアリーが突然倒れた。「ヒュー」がメアリーの声帯に侵入したのだ!ホワイト・ペガサス隊に、ヒューシップが放つ謎の快音波が響く。

異星人ヒューの発した快音波は行方不明になったススムの父、生物学者スギタ博士が持っていたオルゴールと同じものであった。 悩むススムは一人の野球少年と出会ったが、その少年の血管にヒューが侵入した。メドロモンスターを使って、血液の流れをせき止めたのだ。急げ!ワンダービート号!

ススムはドクター・ミヤの姪マユミと海に出かけ、潜って溺れかけた所を海洋生物学者のスコットに助けられる。 異性人ヒューは彼の体内にも潜入し、ススムは命の恩人を救うため緊急出動する。ワンダービート号は呼吸の嵐をかいくぐり、スコットの肺の浄化に成功することはできるのか!?

ススムは天才バイオリニスト、ササキ・ユリヤと知り合う。彼女は何の為にバイオリンを弾くのか悩んでいた。ススムには彼女の気持ちが良く分かった。 ススムのために演奏していたユリヤがバイオリンを落とした。ユリヤの耳にヒューが潜入した。君から音楽を奪う悪魔は僕が絶対やっつける。

ヒューたちの秘密基地は「なぎさシティ」の近くの海中にありビジュール大王は生命元素探索を強固に指令する。 ススムは棒高跳び代表選手権大会に出場し、ライバルのヨシムラに負ける。そんなライバルのヨシムラが練習中に突然涙が止まらなくなる。ヒューがヨシムラの涙腺に侵入した!

朝の光の中を駆けてくる少女。新体操部のエース、コウハタ・レイカ。彼女と話ができただけでススムは舞い上がってしまうのだ。 練習中のミスに、容赦なくコーチの罵声が飛ぶ。再びボールを落としてしまうレイカ。今度はミスでも、コーチのせいではなく、彼女の体に恐怖のモンスターが。

ホバーバイクを飛ばしマユミを連れ去る男の車を追うススム。男につかみかかるが誘拐とはススムの早とちりで彼はマユミが憧れる詩人でアマチュア天文家のホシノだった。 夜空に輝く星たちを昔の人と同じ心で眺めてみることも必要ではないかと言うホシノが倒れた。心臓にヒューが侵入した。

データ集積ロボット・ビオが自分にも恋愛が分かると言い出す。ススムにからかわれて怒るビオだが・・。 そんな時ビオがひとりの可愛い少女、アヤと出会い、不思議な感情を覚える。そんなアヤの歯にヒューが侵入した!「ボクノテデヤッツケテヤル!」一人飛び出すビオにモンスターが迫る!

ヒューシップが発した信号音を電波解析したところ、なんと、ススムが父に贈ったオルゴールと同じメロディーであった! 惑星X23の攻撃命令を拒否したスギタ博士は裏切り者か?リンダという少女の胃の中に緊急出動したススムは彼女の胃液に溶かされる前にモンスターを倒して脱出できるのか!?

ヒューのメロディーを言語分析機から音声に変換して「生命元素」の言葉を得る。ワンダービート号にも電波通信機が設置されたところ、ヒュー反応はリンパ筋に表れた。ススムたちは、固められたリンパ液の中でヒューに交信し、聞きだしたのは「ビジュール星」。ヒューの正体に迫る！

「あの船は宇宙の闇に消えた」ビジュールの言葉だった。いつもススムを励ましてくれたマユミが頭痛で倒れた。 危険な大脳の中での闘いは脳波を刺激し、マユミはうわ言で新ワンダービート号の秘密を。秘密を知ったビジュールシップがワープアウトの直前にススムのインテライドが突入する!!

ビジュールの海底基地に一人で潜入したススムは、バグー将軍に捕らえられる。生命元素の存在を確かめようとするビジュラ姫に助けられ、絶滅の危機に瀕しているビジュール星の話を聞かされる。 マユミに再びビジュール反応が表れホワイトペガサスは緊急修理をしたワンダービート号で出動!

大王からの命令をめぐってビジュール星人の意見が対立し、ビジュラ姫は捕らえられたススムを逃す。 ススムを迎えたホワイト・ペガサスの危機を救ったのは急遽完成した新ワンダービート号だ。古いワンダービート号をマユミの体内に残さない為にススムは涙をのんで破壊のスイッチを押す。

ケイト博士の心臓にビジュール反応が表れた。新ワンダービート号はビジュールとのコンタクトをとるため、ススムが基地から持ち帰った言語翻訳機を備えていた。 だが交信波によって位置が知られメドロモンスターな襲われてしまう。ススムは唯一の手がかりであるビジュラ姫に呼びかけるが。

新兵器Wレーザーが完成した。マイケルとススムは特訓を開始した。そんな時、皮肉にもマイケルの妹プリマドンナを目指すエミリーの右膝関節にビジュール達が侵入してしまった! 出動したワンダービート号が関節に到着した頃にはエネルギーの大半が失われてしまっていた。 Wレーザーしかない!!

宇宙パイロット訓練生のアラマキ・テツヤの父は、ススムの父が乗っていた行方不明中の、グリーンスリーブス号のパイロットだった!!耳にメドロモンスターが侵入し、テツヤが突然不調に襲われる。 ススム達はテツヤの鼓膜から潜入し平衡感覚を阻止している異常なリンパの流れに辿り着く。

ビジュールの体内侵入を一早く知る反応探知機を開発すべく、カトリーヌは研究室に籠る。カトリーヌの父が訪ねてくるが、そっけなく追い返されてしまう。 怒った父が研究室に乗り込んだ時、完成したばかりのビジュール探知機が突然反応する。訳のわからぬまま立ちつくすカトリーヌの父。

美人のリー隊長に恋人出現!先輩で陶芸家の滝耕作の右手の異常に彼女が気づく。皮膚感覚を支配している神経がビジュールに麻痺させられたのだ。 ワンダービート号は皮膚の内側の神経に潜入し、メドロモンスターと闘いに行くが、リーが乗ったインテライド機がビジュールシップに襲われて。

ススムの父スギタ博士からオルゴールを奪ったのは、冷酷な副官ズダーであった。ビジュールを父の仇だと思い込むアラマキ・テツヤがホワイトペガサス隊の一員となる。 突然マイケルの肝臓にビジュールが襲いかかり初出動したテツヤは血気にはやり、もはやススムの言葉も彼を止められない！

人体内の侵入に備え、トリーヌが開発したビジュール探知機を全員時計のようにはめることになった。 ガボー博士が開発した移動実験基地も完成間近となり、リー隊長が狙われた。ドクター・ミヤも不在、難局を乗り切るのはテツヤとススム二人が力を合わせ、ワンダービート号で戦うことだ。

ビジュールはリー隊長の脊髄に実験基地を構築した。ススムとテツヤは基地内に潜り込み破壊工作を。 慌てたビジュールのズダー将軍はオルゴールを落としてしまう。ススムがビジュール星に向かったスギタ博士に託した品だった。何故ズダーが持っていたのか?ビジュラ姫は彼を問い詰めるが。

地上に現れたビジュラ姫は、頑なに口を結んだまま開こうとしなかった。そんな彼女にススムの母リツコは、家族の大切さ、愛の尊さを語った。 人が人を愛することにこそビジュール星人が捜し求めていたものの秘密があるのだった。その時、リツコが倒れた。ズダーの執拗な体内侵入である。

ビジュール大王、自らがホワイト・ペガサス隊に交信してきた。防衛艦隊の出動を押さえつつ、ススム達は地球人代表として基地に乗り込む。そこで彼らを迎えたのは行方不明だったグリーンスリーブス号の乗員とスギタ博士であった。再会と和平に喜ぶ一同の影で、ズダーの陰謀がうごめく。

ビジュール大王を刺しビジュラ姫を人質にしたズダーは、ビジュールシップでワープアウト。ズダーがワープしたのはドクター・ミヤの脳だった！座標を追ってワンダービート号も緊急ワープする。全てを仕組んだのはズダーであった！彼の目的は地球の征服だ！ズダーと最後の戦いの時が来た！