趣味でヒーローを始めた男、サイタマ。

3年間の特訓により、
あらゆる敵を一撃で倒す無敵のパワーを手に入れた彼は、
ひょんなことから弟子となったジェノスと共に、
職業としてのヒーローが所属する
組織・ヒーロー協会に入り、日々活動している。

そんなある日、
突如現れた怪人協会を名乗る怪人達に
幹部の子供を人質に取られてしまったヒーロー協会。

S級ヒーロー達が集まり、
人質奪還のために怪人協会のアジトへの
突入作戦が練られる。

一方、ヒーロー達との戦いの最中怪人協会に連れ去られた
“人間怪人”ガロウは、そのアジトで目を覚ます。