灰原くんの強くて青春ニューゲーム

就職を目前に控えた青年・灰原夏希。かつて高校デビューに失敗して以来、灰色の青春時代を過ごしてきた夏希は、ある日、高校入学直前にタイムリープする。高校生活をやりなおす機会を得た夏希は、灰色の青春を虹色に書き換えることを決意。入学直後、クラスカースト最上位な美男美女のグループに加入したり、片思いをしていた美少女・星宮陽花里と急接近するのだが……。

休日、陽花里やクラスメイトの佐倉詩と七瀬唯乃、凪浦竜也、白鳥怜太とレジャー施設に遊びにやって来た夏希。意気揚々と夏希との卓球勝負に臨む陽花里だったが、その最中、彼女の新たな一面が明らかになり……。その後、他のスポーツをしたり、フードコートで会話に花を咲かせる一同。やりなおし前にはなかった充実した時間を過ごす中、夏希は怜太からとあることを指摘されて！？

唯乃のアルバイト先の喫茶店で働き始めた夏希。さっそくお店にやって来た詩と竜也、怜太に夏希のアレンジ料理をふるまうことになり……。それから2週間後、中間テストに向けて、勉強会を開催する夏希たち。高校生活でお馴染みの“リア充イベント”に参加し、“虹色青春計画”は順調かに思われたのだが、夏希の気が付かないところで問題が発生しているようで……。

カラオケ店で夏希と竜也が気まずい別れをした翌日。学校で顔を合わせる夏希と竜也だったが、2人はギクシャクした雰囲気に。それにつられるかのように、グループ全体に距離ができてしまう。虹色の高校生活があっという間に灰色になり、落ちこむ夏希。そんな時、幼馴染みの本宮美織が夏希のもとを訪れて……。翌日、竜也ともう1度、向き合う決意をした夏希は彼を屋上に呼び出す。

美織の提案で、夏希は陽花里と怜太を加えた4人でダブルデートをすることに。デート当日、一同は買い物をしたり映画を見たり、一緒にご飯を食べたりと楽しい時間を過ごす。そんな中、バスケ部の先輩たちと出会った美織。両者の間には不穏な空気が流れて……。翌日、美織のことが心配になりバスケ部の練習を見に行く夏希。するとそこで、部内で孤立する美織を目撃して！？

負ければ自身が抱えている問題を打ち明けるという条件のもと、夏希から1on1のバスケ勝負を挑まれる美織。勝負に敗れた美織は、バスケ部の先輩たちとの関係がうまくいっていないことや、そのことにショックを受け、味方にパスを出すことが恐くなったと打ち明ける。彼女から助けを求められた夏希は、詩と共に行動を開始する。それから数日後、美織は練習試合に出場するのだが……。

夏休みが間近に迫ったある日、休み中の予定を立てる夏希たち。話し合いの結果、海へ行くことが決まり、一同は期待に胸を膨らませる。そんな中、陽花里だけは浮かない様子で……。そして迎えた夏休み。バイト後に旅行に向けて買い物へ出かけた夏希と唯乃は、陽花里と陽花里の父・星宮征と出会う。征を前にした夏希の脳裏に、やりなおし前のとある出来事がフラッシュバックして！？

突然、陽花里から近くにいると夏希にメッセージが届く。父親との喧嘩が理由で家出をしたと言う陽花里を心配し、夏希はやむを得ず彼女を自宅に迎え入れる。自分の部屋に好きな人と2人きりという状態に緊張気味の夏希……。そんな中、陽花里は父親との関係や自分の過去、将来小説家になりたいという夢を夏希に打ち明けていく。翌日、父親に自身のことを認めてもらうため、彼女はある決意をする。

夏休みのある日の朝、高崎駅前に集合した夏希たちは、新潟県の海水浴場へ向けて出発する。移動中、美織のクラスメイト・本堂芹香と共通の趣味である音楽の話題で盛り上がる夏希。芹香の独特なテンポに振り回されながらも、夏希の新たな交友関係が広がっていく。海辺の町に到着した一行は、海水浴やBBQ、花火を満喫。それは夏希が憧れていた、キラキラした夏の一日で――

夏休みが終わり、日常が戻ってきた9月。夏希は芹香に一緒にバンドを組もうと誘われる。突然の申し出に困惑し一度は断ろうとする夏希だったが、芹香の熱意と、自身の後悔のない青春を送りたいという思いに気付き、バンドに参加することを決意する。さっそく2人は他のバンドメンバーを探し始めるのだが……。一方、陽花里は夏希に対する気持ちに向き合う決意を固めていた。