皮下 真率いる犯罪組織・タンポポを殲滅し「夜桜前線」を見事完遂。
さらに太陽と六美の結婚披露宴も無事に行われ、平穏な日常を送っていた夜桜家
…だったが、新たな任務が発生――!?

ある日、太陽は夢の中で夜桜家初代当主の夜桜つぼみと対話する。
彼女が告げたのは「私を殺して」という願いと、２つの必要なもの。
つぼみの言葉に従い、そのカギを握る皮下との接触をするため太陽は銀級スパイ試験に挑戦するが、「今年の合格者は０」と噂される最凶試験官たちが待ち受ける！

そしていよいよ、動き出したのは不敵な笑みを浮かべる六美たちの父・夜桜 百。
謎に包まれた彼の目的とは!?

夜桜家に降りかかる様々な事件！
試されるのは家族の絆!!
TVアニメ『夜桜さんちの大作戦』新章、作戦開始!!!