ここは、《人》《神》《魔》あらゆる種族の入り混じる神秘の世界ミスタルシアかつて、黒銀の翼持つバハムートにより世界は終焉の危機に瀕したしかし、《人》《神》《魔》は種族の垣根を越えて共闘し多大な犠牲をもってその力を封印したそして、封印の鍵を二つに分け、《神》と《魔》それぞれが有することとなったその鍵が決して一つになることのないようにそれから二千年以上が経ち、世界は安寧の中にあったいつしか《人》はバハムートを唯一無二の存在と考え、恐れ崇めるようになっていたそんな或る日決して盗まれるはずのない《神》の鍵がひとりの少女によって奪われる世界の均衡が緩やかに崩れはじめたバハムートが復活の咆哮をあげるとき世界はまた絶対的絶望の淵に沈んでいく世界よ、滅べ。誰かが、ただ切に願った