機動戦士ガンダムAGE

謎の敵UEに故郷を襲われ、孤児となったフリットは、ノーラの連邦軍基地で育てられた。フリットは母から授かったAGEデバイスの中の設計図を元に救世主と呼ばれたMS『ガンダム』を作り上げる。そんな時、ノーラはUEの襲撃を受け、フリットは、ガンダムを起動する…！

UEの攻撃を受けて崩壊していくノーラ。司令官ブルーザーは、住民たちの避難を急ぐ。フリットもまた、ガンダムを動かしコロニーを脱出しようとするが、逃げ遅れた少女を発見する。少女を救い宇宙へと出るフリットに、UEが襲いかかる！ そして、ついにAGEシステムの力が発動する…。

ノ－ラ崩壊のタイムリミットが迫る。逃げ遅れた少女をガンダムに乗せ、宇宙に出たフリットだったが、そこで新たな黒いモビルスーツ型の敵に遭遇する。一方、グルーデックは艦長として、ディーヴァによってコロニーコアを制御して、多くの人々を崩壊から救う作戦を決行するが…。

ディーヴァは新たなコロニー『ファーデーン』を目指す。その時、ヒーリングスリープから、エースパイロットのウルフが目覚める。『白い狼』という異名を持つ彼は、白いMSは自分が乗るべきだと主張、フリットにガンダムを賭けた模擬戦を挑む…。

ファーデーンに入港するディーヴァ。幾度かの戦闘を経験し、フリットはもっと強くなりたいと願う。ファーデーンで出会った少年デシルをディーヴァに招くフリットだったが、デシルには意外な思惑があった。襲い来るUE。しかし、出撃したガンダムに乗っていたのは…!?

ファーデーンの街で起こった戦闘に巻き込まれ、フリットとエミリーは地下階層へと避難する。そこで出会ったイワークという男から、街が二つの勢力に別れて抗争を繰り返していることを聞く。そんな時、戦闘が続く地上に迷い込むイワークの娘リリア。助けに行くイワークだったが、そこにUEが現れる…。

ザラムに捕らえられたフリットは、首領ドン・ボヤージと出会う。フリットは、ボヤージにザラムとエウバの抗争について抗議するが、聞き入れてもらえず。そこに攻撃を仕掛けてくるエウバのボス、ラクト・エルファメル。またも始まるコロニー内の戦闘。果たして…。

ザラムとエウバは、襲撃してきたUEに、即席の共闘軍で立ち向かう。フリットもまた、新ウェア『タイタス』で対抗する。フリットは、自分の思いをぶつけ、いがみ合うザラムとエウバを一つにしようと奮戦する。そんな時、援軍となる新たな白いMSが現れるが…。

新たな機体『Gエグゼス』の出所をウルフに問い詰めるフリット。ウルフはフリットを馴染みの場所であるマッドーナ工房へと連れて行く。そこでフリットは衝撃的な光景を目にする。なんと、UEのモビルスーツ型が置かれていたのである。その時、突如UEのモビルスーツ型が動き出す…！

ファーデーンに襲い来るUEの大部隊。ザラムとエウバは、コロニーを守るべく共同戦線を張る。しかし強力な敵の前に味方は弱きになっていく。ボヤージは自らの身を賭して、味方の軍を鼓舞するが…。壮絶な戦いの中フリットは、ガンダムを新たなるウェア『スパロー』に換装する…！

ミンスリーに到着するディーヴァ。UEの要塞攻略に向けた会議を行うため、大富豪バーミングスの屋敷に向かう。そこで、フリットはバーミングスに引き取られていたユリンと再会する。心を通じ合わせる二人。一方、連邦軍は、反逆者であるグルーデックを捕えようとしていた…。

宇宙要塞アンバット攻略の準備を終えて、ミンスリーを発つディーヴァ。しかしその行く手には、グルーデックを捕えるべく、連邦軍将校グアバランの艦隊が待ち受けていた。そこに突如、ＵＥが襲ってくる。この隙に逃げるか、グアバランの艦隊を救うか、グルーデックは決断を迫られる。

ついに宇宙要塞アンバットとの決戦が始まる。襲い来るUEの大群。ディーヴァとザラムエウバ連合軍は、死力を尽くして戦う。そして、UEに先制するため、ディーヴァは新たな力を発動させる。果たして、その光は人類に勝利を導くことができるのか…!?

アンバット攻略戦は続く。フリットは敵の黒いモビルスーツ型を操る正体を知り驚愕する。さらにそこに現れるピンクの機体。その正体にフリットは混乱し、どうして戦わなければならないのかと、問いかけるが…。

グルーデックたちは、宇宙要塞アンバット内部へ突入する。敵の司令官ギーラ・ゾイが操る最新鋭MS、デファースとガンダムとの一騎打ちとなるが、UEへの強い憎しみに突き動かされるフリットは、ついにギーラを追い詰める。しかし、そこには、驚くべき真実が待っていた…。

25年後、地球連邦軍とヴェイガンとの戦争は、未だ終結することなく続いていた。フリット・アスノの息子、アセムが住む、コロニー・トルディアは、ヴェイガンの襲撃を受けてしまう。アセムはヴェイガンから、人々を守るため、隠されたガンダムを起動する…。

MSクラブに所属し、学園生活を謳歌するアセムたち。そんな時、転入生のゼハートがクラブに入れて欲しいとやってくる。アセムたちはMS選手権に向けてともに準備することになる。ところが、選手権当日、町はヴェイガンの襲撃を受ける。アセムのガンダムと対峙する新たなる敵とは…!?

アセムとゼハートはともに卒業式を迎える。しかし、ヴェイガンの襲撃によって、状況は一変し、コロニーは混乱に陥る。連邦軍とヴェイガンは激しい戦いとなり、アセムもまたガンダムに乗り込む…。

連邦軍へ入隊したアセム。そこには多くの仲間たちとの出会いがあった。宇宙戦艦ディーヴァは、アセムたちを乗せてビッグリングへと旅立つ。ディーヴァは、ヴェイガンとの交戦状態に。ついにアセムは、新たなるガンダム、AGE-2で、出撃する…。

ディーヴァは、ヴェイガンとの戦闘を避けるため、危険な航路である岩礁宙域ルートを進む。しかし、それを見抜いていたゼハートは岩礁宙域に待ち伏せて攻撃を仕掛けてくる。ゼハートが乗る赤い新型モビルスーツがアセムに迫る…。

ビッグリングに到着したディーヴァ。アセムは、自分の能力を知るため、次世代パイロット訓練プログラムを受ける。しかし、その結果を受けてアセムは苦悩する。そこに、ウルフが現れ、アセムをある場所へ連れて行くのだが…。

ビッグリングに侵攻するヴェイガン。そこにヴェイガンのＸラウンダー部隊『マジシャンズ8』が投入される。さらにデシルとゼハートも参戦し、連邦軍を追いつめていく。そんな中、フリットは司令官としての才覚を持ってヴェイガンに立ち向かう…。

フリットたちは、ソロンシティ内の企業が、ヴェイガンに協力しているという確証をつかむため、潜入作戦を決行する。アセムは、民間人に危険が及ぶ作戦内容に疑問を抱き、フリットに意見するが、はねつけられる。そんな父に反発してアセムはディーヴァを飛び出してしまう…。

グルーデックはフリットに、ヴェイガンへの内通者が連邦軍の中にいると告げる。一方、拘束室から解放されたアセムは、気晴らしにソロンシティの繁華街へと出かけていた。そこでアセムは、ゼハートと出会う。ゼハートはアセムを戦いから引き離そうと説得するが…。

破壊したヴェイガンのMSから、フリットたちは、資質のない者であってもＸラウンダーと同様の力を引き出せる装置ミューセルを発見する。しかし、ミューセルは使用者の脳に大きな負担をかけるものだった。アセムは、さらなる力を求め、ミューセルを装備して出撃してしまう…。

ヴェイガンは、地球への大規模な侵攻を開始する。移動要塞ダウネスを用い、地球に最も近いコロニー、ノートラムに攻撃をしかけてきたのだ。対する連邦軍は最新鋭兵器フォトンリング・レイで迎え撃つ。壮絶な戦いの中、アセムの前に、ゼハートとデシルが立ちふさがる…。

アセムとゼハートはおたがいの使命を背負い、最後の一騎打ちを繰り広げる。戦闘は最終局面を迎え、連邦軍の秘策がダウネスを大破させる。しかしそれによって、ダウネスは大気圏へと落下を始める。このままでは、地球に大きな被害が出てしまうが…。

『勇気の日』と呼ばれる慰霊祭の日、地球首都ブルーシアでは、地球連邦首相オルフェノアが演説を行っていた。地球に侵入したメデル・ザントは、演説会場への攻撃を画策する。そんな中、演説会場に入ったフリットはオルフェノアを糾弾する…。

アセムの息子、キオは13歳になっていた。そんな時、キオが暮らす地球の町オリバーノーツをヴェイガンが襲い、首領イゼルカントは地球侵略の全面的な開始を宣言する。この危機的状況に、キオとフリットは、新たなるガンダム、AGE3を動かそうとするが…。

戦場となり混乱する町。フリットは、この緊急事態に、基地に駐留しているディーヴァの発進を命ずる。フリットを疎ましく思う基地司令ドレイムスは、ディーヴァに寄せ集めのクルーたちを乗せる。熾烈な戦いが続く中、再びディーヴァが動き出す…。

ディーヴァは、砂漠上空にてヴェイガンの精鋭部隊『ファントム3』の攻撃を受ける。砂漠に潜む狡猾な敵の戦法に苦戦するディーヴァ。この状況を打ち破るべく、AGEシステムは、砂漠戦に特化したガンダムの新たな形態を生み出す…。

ロストロウランに到着間近のディーヴァだったが、艦内にスパイがいるという事実が判明する。そしてその時、ロストロウランは、敵大部隊の襲撃を受けていた。激しい戦闘の中、キオは仲間であったスパイを追いかけ、戦争の中で生きる人間のつらい現実を知るのだった…。

ヴェイガンの侵攻により、戦場となったロストロウラン。激しい戦闘が繰り広げられる中、ゼハートはプラズマ粒子爆弾による基地破壊計画を目論む。基地全滅の危機に、ディーヴァMS隊が爆弾の排除を試みるが…。

月にある連邦軍基地ルナベースへと進路を取るディーヴァ。暗礁宙域サルガッソーに差し掛かった時、悪名高き宇宙海賊ビシディアンの戦艦が姿を現す。ヴェイガンにも連邦にも所属しないビシディアンは、力ずくでもディーヴァを奪い取ろうとするが…。

ビシディアンが残した謎のメッセージカプセル。それにより、この戦争に関わる「呪われた秘宝」の正体が明かされる。ヴェイガンが持つ驚異的な軍事技術や、それに関わるかつて地球連邦が隠蔽した事実に、一同は衝撃を受ける。一方、ヴェイガン陣営ではディーヴァを包囲する新たな作戦が進行していた…。

ゼハートとザナルドは、ガンダムを捕獲すべく、競い合うようにキオのAGE-3を追い詰めていく。その攻撃は苛烈をきわめ、キオは窮地に陥る。そんなキオを救うため、フリットはAGE-1で出撃する。しかし、そこには、罠が待ち構えていた…。

ヴェイガンの本拠地、セカンドムーンに連れ去られたキオ。そこでキオは、首領イゼルカントと出会う。キオはヴェイガンの大規模な施設や軍備を見せられて、驚きを隠せない。さらに、イゼルカントはキオに、『ヴェイガンの真実』を見せようとする。それは、火星圏の民が背負った、悲しい現実だった…。

ルウとの出会いによって、キオの中で何かが変わっていく。ヴェイガンとは本当に憎むべき敵なのか？と思い悩むキオから、イゼルカントは、ガンダムの解析のために必要な情報を聞き出そうとする。しかしキオは情報提供の条件として、火星圏に蔓延する病に効く薬を要求する。ルウに与え、彼女の病気の進行を少しでも遅らせるためである。薬を届けるため、キオはルウに会いに行くようになり、二人はしだいに心を通わせていく。そんな…

ある人物の助けにより、セカンドムーンを脱出したキオ。しかし、そこに立ちはだかったのは、ヴェイガンの首領イゼルカントだった。イゼルカントが操る、ヴェイガンのガンダム、『ガンダムレギルス』は、圧倒的な力を見せつける。火星圏の実情を知り、動揺するキオに、イゼルカントはプロジェクト・エデンの真意を語り、ヴェイガンに連れ戻そうとする。しかし、キオもまた、自分の中に生まれた感情をイゼルカントにぶつける。今、…

地球圏に戻り、ディーヴァの仲間たちと再会したキオ。キオは、フリットに火星圏でのことを話すが、フリットの返答はキオの期待したものではなかった。そして今、キオは、自分自身の考え方で戦争と向き合う決意をする。新たなるガンダム、AGE-FXとともに。

連邦軍によるルナベース奪還作戦での戦いはさらに激化する。その戦いの中で、キオは、コクピットを破壊しないようにヴェイガンのMSを撃破し、パイロットを救う戦い方を続けていた。キオは戦場に現れたフラムに、ともにXラウンダーの力を使い、争いをやめさせようという提案をするが…。

連邦軍とヴェイガンの戦いは、両軍とも譲らない激しいものとなっていた。だがそこへ元連邦のパイロット、ジラード・スプリガンが参戦する。キオは、ジラードが連邦とヴェイガン、両陣営の実情を知る人間だと知り、戦いを終わらせるための対話を試みるが…。

月面上の戦いはさらに激しさを増す。連邦軍ではプラズマダイバーミサイル発射の準備がなされていた。セリックは、強力な殺戮兵器であるミサイルの発射を止めされるため、ヴェイガン兵を降伏させようと試みる。

イゼルカントは、ゼハートにプロジェクト・エデンの真の目的を告げ、自らの代わりにヴェイガンを率いるよう命じる。ゼハートは全てを理解した上で、イゼルカントの言葉に従うことを決意する。一方、連邦側では、フリット、アセム、キオ、それぞれの戦争に対する考え方の違いから三人による口論が繰り広げられていた。フリットのヴェイガン殲滅という強い意志に、キオは、ヴェイガンの全てが悪いわけじゃないと立ち向かう。何のた…

人類の過去の戦いにおけるテクノロジーが封じられた悪魔の秘宝『EXA-DB』。それを守護していたのは、巨大な怪物モビルスーツだった。ヴェイガンの最高司令官となったゼハートは、自らにその資格があるかを問うため、イゼルカントに託されたガンダムレギルス一機でシドとの戦闘に挑む。だが、シドはレギルスの攻撃を次々とはねつけてしまう。追い詰められるゼハート。絶体絶命と思われたその時、レギルスの前に、黒いMSが…

ヴェイガンは、セカンドムーンとラ・グラミスの連携による、大規模な侵攻作戦を実行しようとしていた。連邦もまた、それを迎え討つべく、宇宙要塞ラ・グラミス攻略作戦を発令する。両軍では最終決戦に向かう戦士たちが、それぞれ思いを巡らせる。果たして、この戦いの先にはどのような結末が待っているのか。地球の命運をかけた、両軍の激突は目前であった。

ラ・グラミスでの激しい戦闘が続く中、キオが戦場で出会ったのは、ヴェイガンでありながら、かつて心を通じ合わせたディーンだった。キオにとって、Xラウンダーの力を使い襲ってくるディーンは、誰よりも手強い相手だった…。

ゼハートは、プロジェクト・エデン達成のため、仲間の犠牲を覚悟の上で、ディグマゼノン砲を再発射する。ディーヴァは撃沈されるが、フリットたちは攻撃を予測し、ディーヴァクルーとガンダムを救う。この攻撃の失敗によって、ゼハートは追いこまれていく。その時、アセムは…。

宇宙要塞ラ・グラミスでの戦いは最終局面となる。連邦とヴェイガンは、共に大きな被害を受けるものの退かず、戦況はさらに激しさを増していく。長い戦いの果てに、フリット、アセム、キオ、そして、イゼルカントは、どのような結末を迎えるのか？