拡張少女系トライナリー

大ファンのアーティスト、FreyMENOWのライブのため、東京にやってきたつばめ。しかしライブは異様な雰囲気に包まれ、FreyMENOWは囚われ、つばめも命を狙われる。そこに神楽坂トライナリーのメンバーが駆け付け、事態の収拾に当たるが、その混乱中で、つばめの力が目覚める。

新人隊員としてトライナリーに参加することになったつばめ。同じく新人隊員の神楽も合流し、２人は急速に仲良くなってゆく。トライナリーとしての任務をこなしつつ、カフェでのおしゃべりや、気になる男子とお祭りに繰り出したり、ゆるやかな普通の日常を送るつばめたち。

アーヤの秘められた日常を探るガブ、神楽と秋葉原でデートするつばめ……普通の女の子としての、トライナリーのメンバーの時間が流れて行く。ある時、まるでゲームの中の空間を模したようなフェノメノンが発生。事態に当たるメンバーは、まるでゲームのキャラクターのように、戦いを繰り広げることになる。

トライナリーは、みやびの実家のある海岸で合宿をすることに。各々が海での楽しい時間を満喫する中、前回の任務の際、神楽との関係がぎこちなくなったつばめは、なんとか仲直りしようと会話を試みる。しかし神楽は予想外の態度を取り、そしてそこに、フェノメノンまでが発生するのだった。

自分たちのおよび知らぬところで事態は進行し、状況に流されるままとなるトライナリーのメンバーたち。しかしそれでも、自分たちなりに道を切りひらこうと、それぞれに行動をはじめる。そしてやがて世界の真実が、彼女たちの目の前に、そのいびつな姿を現そうとしていた。

明らかになった世界の真実は、トライナリーのメンバーたちにとって、そしてつばめにとって、あまりにも過酷なものだった。複雑な因縁の果てに現れた意外な敵を相手に、それでも少女たちはあきらめることなく、友情と、純粋な想いを胸に戦いに赴く。そこにあるのは、さらなる大きな謎との対決であった。