暗殺者である俺のステータスが勇者よりも明らかに強いのだが

平穏な日常は突如奪われ、織田晶とクラスメイトは異世界に召喚された。その地の国王が語るのは「魔王を倒し国を救ってほしい」というお決まりの言葉。職業が暗殺者と判明した晶は、自分のステータスが勇者をも凌駕する異常な数値であることに疑問を抱く。晶は国王らに不信を感じ単独行動を決意。情報収集のさなか騎士団長サランの知遇を得る。そしてクラスメイトとともに赴いた地下迷宮で、晶は生死の狭間に立つ。

迷宮からの生還を果たした晶は、勇者佐藤の異変に王女と国王の策謀が関わっていることを知った。その翌日、晶はこの世界での唯一の理解者を喪失する。殺人の濡れ衣を着せられ逃亡者となってしまった晶は、亡き恩人の助言を胸に地下迷宮での潜伏を開始。命を削るような魔物との戦いを経てレベルを上げていく。深層で遭遇した美しいエルフの少女、彼女の名はアメリア。それは晶の運命を変える出会いだった。

アメリアとの共闘で倒した８０階層のボスが、真の姿を露わにする。ブラックキャットという名の魔物は、魔王から晶への伝言を携えていた。役目を終えたので殺せと言い放つブラックキャット。晶は拒絶するが、生かしておいてはボス部屋の閉鎖は解除されず、いずれ全員が飢えて死んでしまう。残された唯一の打開策は、主従の契約。失敗は死を意味する儀式のさなか、晶はブラックキャットの心の底を見る。

フォレスト大陸──レイティス国から遠く離れた、エルフの住まう地。迷宮を脱するために晶たちが入った転移魔法陣の出口は、アメリアの故郷に繋がっていた。しかし家族との再会はアメリアにとって心温まるものではなく、事態は妹キリカと晶の決闘という殺伐とした局面へと展開する。激しい戦いの末、国王はキリカに真実を明かす。懺悔にも似た告白は国王とキリカの、そしてキリカとアメリアの過去を清算する。

海原を渡り、晶たちは新たな舞台に至り着く。獣人の大陸ブルート。そこで出会ったクロウは卓越した技術を持つ鍛冶師にして、先代勇者パーティーの生き残りだった。決意を込めた直談判に臨むアメリアに、クロウは「アドレアの悪夢」を語る。１００年あまりの時を経た回顧には、夜の悔恨とクロウの悲憤がまざまざと焼き付けられていた。そして突如現れた因縁の魔族により、アメリアは窮地に立たされる。

嵐の如く吹き荒れる凄まじい影魔法によって、港町ウルを蹂躙する魔物の群れは一掃された。しかし晶が払った代償は甚大で、魔力が枯渇し気を失ってしまう。目覚めるや否や、晶は囚われの身となったアメリアを救うべく動き出す。道中予期し得ぬ再会を果たしつつ、ブルート迷宮の内部で夜の述懐を聞く晶。それは正義という概念の危うさを示唆していた。やがて辿り着いた迷宮深層で、アメリア奪回を懸けた魔族との戦いが始まる。

辛くも魔族アウルムに勝利した晶。しかし息つく暇も無く、そこに魔族の序列二位マヒロが現れる。意外な出自を仄めかすマヒロは、桁違いの強さで晶を圧倒。夜は唯一の対抗策を晶に具申する。晶は変身した夜との連携により、マヒロと互角に渡り合う。しかし完璧な死角に仕掛けられていた罠が、晶を襲う。絶体絶命の危機。理外の反撃。混沌と化した戦いを終息させる者は誰か。そして戦いの後、晶はある誓いを立てる。

勇者パーティーの誘いに応じ、晶たちは祭りで賑わうマリの街へ。ここでとあるコンテストが催され、優勝者には豪華賞品が授与されるという。賞品は食べ物に違いないと主張するアメリアはコンテスト参加を表明。受付で出会ったラティスネイルと名乗る少女と意気投合し、楽しい時間を過ごす。一方晶はクロウとの会話で、人身売買の元締めとクロウの妹の仇が同一人物であることに気付く。この一致は偶然か、あるいは必然なのか。

晶と勇者パーティーは今後の方針について協議。最終目的が同じであることを確認し、一旦は別行動を取るということで合意した。かくして晶、アメリア、クロウの三人は首都ウルクシティへと赴く。そこで再会したリアは、晶とアメリアを王宮へと案内する。しかし、謁見の場においてウルク国の王は晶を露骨に侮り、あまつさえ身勝手な要求を口にする。それに腹を立てたアメリアをなだめるため、晶は近衛騎士と戦うことになる。

アメリアを付け狙う人身売買の元締め。クロウの妹の命を踏みにじった仇。そしてサランの死を誘発した者──三つの点が一本の線で繋がり、晶とクロウの復讐が重なる。その対象は、グラム・クラスター。晶の本心を感じ取り思いやるアメリア。クロウへの慕情を滲ませるリア。勇者佐藤もまた、晶との関わりで生じた感情を率直に吐露する。美しい街並みの中で晶は迷い、そこに幼き日の己を見る。

夜とラティスネイルという奇妙なコンビでの道行きは、終わりを告げつつある。それはすなわち、晶にとって決断に要する情報が十分に収集されたことを意味していた。一同に重苦しい空気が流れる中、ラティスネイルは気分転換を提案。晶たちは街に出ることに。夜は晶を気遣い、差し向かいで話そうと誘う。それは単なる主従を越えた情が成せる振る舞いだった。晶は夜の思いに応えるように、自分の弱さを語る。

遂にグラムとの対面を果たした晶。目の前にいる男は悪逆にして卑劣な本性を隠そうともせず、アメリアを手中に収めることが当然であるかのように振る舞う。さらにはサランの死を愚弄して見せたことで晶の深い怒りを呼び起こし、晶はグラムを殺すべき者と断じるに至った。アメリアと夜をも遠ざけ、ひとりで決意を固めた晶は準備に取りかかる。しかしその時──思いもよらぬ人物が、晶に語りかけるのだった。